نشأة المركز من منطلق سعي وزارة التعليم العالي إلى تفعيل توجه عصري لدعم مسيرة البحث العلمي في المملكة فقد طرحت على الجامعات السعودية فكرة التنافس للتقدم لإنشاء مراكز تميز بحثية من خلال كراسة مواصفات وشروط أرفقت مع خطاب معالي وزارة التعليم العالي رقم 5166 بتاريخ 26/1/1429هـ الموجه إلى جميع الجامعات السعودية، وذلك ضمن المرحلة الثانية من مشروع مراكز التميز البحثي. ولما تميزت به جامعة الإمام محمد بن سعود الإسلامية من عناية واهتمام بالعلم الشرعي والعلوم العربية، ولما لها من إسهام فاعل مؤثر في خدمة الفقه الإسلامي على مدى أكثر من نصف قرن، فقد نالت ثقة وزارة التعليم العالي بتوقيع عقد تمويل مركز التميز البحثي في فقه القضايا المعاصرة وذلك في اليوم العاشر من شهر رجب عام 1429هـ الموافق لليوم الثالث عشر من شهر يوليو 2008م. وقد باشرت الجامعة منذ توقيع العقد المهام المناطة بها لتجسد المركز واقعا ملموسا، يخدم الأهداف التي أنشئ من أجلها، وترى آثاره في الواقع . وصدرت القرارات الإدارية من معالي مدير الجامعة الأستاذ الدكتور / سلمان عبد الله أبا الخيل –وفقه الله- كخطوة تنفيذية للعقد بتشكيل مجلس الإدارة والهيئة التنفيذية الممثلة في إدارة المركز بتاريخ 23/9/1430هـ الموافق 23/9/2008م. رؤية المركز أن يكون المركز مرجعا في القضايا المستجدة التي تحتاج إلى تحديد موقف الشرع منها ، ويجمع الجهود البحثية تحت مظلة واحدة،فيوفر الجهد والمال،ويستثمر التقنيات الحديثة في مجال البحوث الشرعية المتخصصة في فقه النوازل ، ويشكل عاملا فاعلا في إبراز دور المملكة الريادي في العالم الإسلامي . رسالة المركز يهتم المركز بالبحث في المسائل المستجدة التي تحتاج إلى بيان حكمها الشرعي،وفق منهج علمي يأخذ في الاعتبار ظروف الواقعة ومآلاتها،ويولي اهتماما خاصا بالقضايا التي تهم المجتمع السعودي ، ويقدم المشورة للجهات الحكومية والأهلية ، ويسهم في تدريب الباحثين ورفع كفاءتهم من خلال ما يقدمه من دورات وورش عمل وندوات .